Начало формирования гигиенической научной и педагогической школы в Оренбурге было связано с эвакуацией Харьковского медицинского института и образованием в августе 1944 года на его основе Оренбургского мединститута.
Кафедра располагалась во втором учебном корпусе и занимала одну комнату. В штате было 3 сотрудника (Жилин М.Г., Никольский и Зубарева В.Г.), которые приступили к обязанностям с 1 октября 1944 года (приказ №13 от 01 сентября 1944 г.).
Первым заведующим кафедрой общей гигиены был Модест Григорьевич Жилин (заведовал с 1944 по 1963 г.г).
В 1940 году защитил в Ташкентском медицинском институте кандидатскую диссертацию «О перекрестной инфекции и суперинфекции при брюшном тифе и паратифах», но в связи с войной диплом кандидата наук получил только в марте 1946 года. В соответствии с приказом №1 от 29.08.1944 года Модест Григорьевич вошел в состав первой приемной комиссии Оренбургского медицинского института. Приказом №13 от 1.09.1944 года назначен заведующим кафедрой общей гигиены и следующим приказом утвержден в должности декана. 31 марта 1945 года ему присвоено ученое звание доцента. В 1952 году подготовил докторскую диссертацию на тему: «Кислоспиртовые напитки. Микрофлора. Технология брожения. Гигиеническое значение». Ученая степень доктора медицинских наук присуждена только в 1954 году после переработки диссертации под новым названием «Кумыс (микрофлора, технология производства, гигиеническое и диетическое значение, антибиологические свойства». 21 января 1955 года Модесту Григорьевичу присвоено ученое звание профессор. Подготовил 2 кандидатов наук, в том числе будущего заведующего кафедрой Э.Н. Балтенко. В период руководства кафедрой М.Г.Жилиным проводилась работа по оснащению приборами и учебными пособиями, разработан оригинальный лекционный курс по гигиене для студентов лечебного факультета, единственного в то время в мединституте. После 1963 года еще два года работал профессором-консультантом. Профессор М.Г. Жилин награжден медалью «За доблестный труд», знаком «Отличник здравоохранения».
В декабре 1963 года заведующим кафедрой был назначен доцент Арсений Александрович Шмаков.
В феврале 1959 году защитил кандидатскую диссертацию на тему «Запыленность жилых кварталов г. Асбеста и ее влияние на здоровье детей». В 1962 году на конкурсной основе был избран на должность доцента кафедры гигиены Оренбургского мединститута. 4 октября 1963 года ему присвоено ученое звание доцент. 13 декабря 1963 года избран на вакантную должность заведующего кафедрой общей гигиены. Основным направлением научных исследований А.А. Шмакова было изучение влияния выбросов Медногорского медносерного комбината на здоровье населения и разработка необходимых гигиенических мероприятий. Наряду с научной деятельностью активно участвует в педагогическом процессе, составляет и перерабатывает методические пособия. За время заведования кафедрой руководил работой по определению санитарных условий выпуска сточных вод Орско-Халиловского металлургического комбината в реку Урал, предложил способ дезодорации парообразных продуктов, образующихся в процессе утилизации сернисто-щелочных отходов нефтепереработки. Совместно с Э.Н.Балтенко, В.И.Заком и Л.Е.Олифсоном проводит изучение зобогенных факторов в Оренбургской области. Им также изучались гигиенические аспекты применения ядохимикатов. В октябре 1967 года конкурс на должность заведующего кафедрой выиграл Олег Григорьевич Неронский. В 1961 году в Киевском медицинском институте защитил кандидатскую диссертацию на тему «Гигиеническая оценка условий труда маляров при пульверизационной окраске на Минском автозаводе». В должности заведующего кафедрой гигиены Оренбургского медицинского института проработал всего полгода.
В 1968 году исполняющим обязанности заведующего кафедрой назначен Эдуард Николаевич Балтенко.
В 1965 году защитил кандидатскую диссертацию на тему «Материалы к характеристике эндемии зоба в Оренбургской области (по данным санитарно-гигиенических и экспериментальных исследований». В 1968 году на конкурсной основе был избран на должность доцента кафедры гигиены Оренбургского медицинского института. При его участии сотрудники кафедры впервые приняли участие в разработке научной хоздоговорной темы по гигиеническому обоснованию водоснабжения на Гайском горно-обогатительном комбинате. В течение 1968-1970 г.г. исполнял обязанности заведующего кафедрой. 7 декабря 1970 года в связи с прибытием на кафедру нового заведующего, избранного по конкурсу, был освобожден от исполнения обязанностей зав. кафедрой.
В октябре 1970 года на должность заведующего кафедрой гигиены был избран известный в стране ученый-гигиенист Олег Николаевич Савельев. К моменту участия в конкурсе на должность зав.кафедрой гигиены Оренбургского мединститута Олег Николаевич опубликовал 46 научных работ, в том числе 8 в центральных журналах, под его руководством были выполнены 3 кандидатские диссертации.
16 октября 1970 года Совет ОГМИ утверждает его на должность заведующего кафедрой гигиены. Основным направлением исследований в 1970-1974 годах является изучение влияния условий обучения и режима дня на состояние здоровья учащихся. В 1975 году О.Н.Савельев защищает докторскую диссертацию на тему: «Гигиенические основы профилактики близорукости и сколиотической осанки у учащихся-подростков». В 1978 году ВАК СССР утверждает его в ученом звании профессор по специальности «Гигиена». Под его руководством выполняются 2 диссертационные работы (Л.Л.Богомолов и Л.А.Партенко). В научном плане проводит изучение открытых водоемов бассейна р.Урал, источников водоснабжения сел Оренбургской области, изучает условия труда работающих на Оренбургских газовых промыслах. Под его руководством проводились научные исследования (по хоздоговорным темам) по изучению влияния условий труда на организм работающих и разработке профилактических мер. Много работ посвящено изучению проблем освещенности в гигиене детей и подростков. При организации педиатрического факультета в мединституте разработал методические указания для студентов и преподавателей к практическим занятиям, курс лекций по всем разделам гигиены, проведено оснащение практических занятий по курсу гигиены детей и подростков. За многолетнюю плодотворную педагогическую, научную и общественную деятельность приказом министра здравоохранения РСФСР №447-л от 4.04.78. объявлена благодарность. За 10 лет работы на кафедре гигиены ОГМИ (1970-1980) им опубликовано около 30 научных работ.
В 1980 году исполняющим обязанности заведующего кафедрой назначен доцент Василий Николаевич Васильков.
В 1977 году защитил кандидатскую диссертацию на тему: «Физиолого-эргометрический анализ труда забойщиков глубоких шахт Донбасса». В октябре 1978 года избран по конкурсу на должность доцента кафедры общей гигиены Оренбургского медицинского института. В августе 1980 года В.Н.Василькову было присвоено ученое звание доцента. В этот период, совместно с проф. О.Н.Савельевым, проводил исследования по оптимизации освещенности для школьников и студентов с пониженной остротой зрения. 1 сентября 1980 года назначен исполняющим обязанности заведующего кафедрой общей гигиены и руководил кафедрой до 1986 года.. Доцент В.Н. Васильков изучал проблемы гигиены труда и состояние здоровья рабочих, занятых в производстве теплоизоляционных материалов и вопросы профессиональной адаптации рабочих.
С апреля 1986 года по настоящее время кафедрой руководит профессор, доктор медицинских наук Виктор Михайлович Боев.
В ноябре 1977 года защитил кандидатскую диссертацию «Кровеносные сосуды спинномозговых ганглиев». Работал на кафедре физического воспитания с курсом лечебной физкультуры и врачебного контроля. В 1985 году защитил докторскую диссертацию на тему: «Нарушения функций высших отделов ЦНС при больших физических нагрузках и их предупреждение предварительной адаптацией и антиоксидантами». В 1986 году был избран заведующим кафедрой общей гигиены. В 1987 году ВАК СССР утверждает его в ученом звании профессор по специальности «Гигиена». В 1991 году был назначен заместителем председателя диссертационного совета по защите диссертаций на соискание ученой степени доктора наук Д 084.51.01. После реорганизации в 2001 году возглавил диссертационный совет по защите диссертаций на соискание ученой степени доктора наук Д 208.066.01 и назначен заместителем председателя Совета Д 208.066.03. Усилиями профессора В.М. Боева в 1996 году открыт и успешно работает медико-профилактический факультет. Боев В.М. - врач-гигиенист высшей категории, за его плечами большая практическая работа в органах санэпиднадзора. Значителен вклад В.М.Боева в развитие гигиенической науки. Им впервые дана достаточно полная медико-экологическая характеристика состояния окружающей среды и здоровья населения Оренбургской области, изучены региональные особенности влияния на человека факторов природной и производственной среды. Под руководством В.М.Боева и с его непосредственным участием реализуется масштабный цикл работ по радиоэкологическим и медицинским последствиям Тоцкого ядерного взрыва. Предметом глубоких методических исследований в серии его работ явился анализ связи антропогенных факторов с заболеваемостью основными формами неинфекционной патологии, с цитогенетическими, иммунными и психофизиологическими нарушениями у детей. На новом методическом уровне возобновлены исследования по изучению эндемического зоба. Плодотворная научная деятельность в ВУЗе позволила ему опубликовать свыше 500 научных работ, из них 17 монографий и книг. На кафедре и под его руководством выполнено и защищено 12 докторских и 46 кандидатских диссертаций. Профессор Боев В.М. ведет большую научно-организационную работу, являясь инициатором формирования нового уровня комплексирования научных исследований ВУЗа и центров госсанэпиднадзора в решении проблем санитарно-экологических ситуаций на территории области, в создании научных основ социально-гигиенического мониторинга, в подготовке кандидатов наук из числа практических работников центров госсанэпиднадзора. В.М.Боев - член Научного совета по экологии человека и гигиене окружающей среды РАМН, председатель и заместитель председателя 2 Диссертационных советов по защите докторских диссертаций, возглавляет проблемную комиссию по специальностям «Гигиена, экология, эпидемиология» ГОУ ВПО «Оренбургская государственная медицинская академия Росздрава», председатель регионального отделения Всероссийского научно-медицинского общества гигиенистов и санитарных врачей, член редколлегии 2 журналов рецензируемых ВАК. В 1976 г. награжден орденом «Знак Почета», в 1997 году знаком «Почетный работник госсанэпидслужбы», в 1999 году присвоены Звания «Заслуженный работник высшей школы РФ», в 2008 году «Заслуженный деятель науки РФ». Научные заслуги отмечены Министерством здравоохранения РФ, Администрацией Оренбургской области в 2000 и 2003 гг. удостаивался звания «Ученый года». Работы по медико-гигиеническим и экологическим аспектам охраны здоровья населения Оренбургской области неоднократно удостаивались звания «Лауреата премии администрации Оренбургской области в сфере науки и техники» (2000, 2001, 2002, 2003, 2004,2005). В июне 2009 года Боев.В.М. был избран на должность ректора и с сентября 2009 года возглавляет Оренбургскую государственную медицинскую академию.