Кафедра организована с 1 сентября 1988 года и первоначально называлась «поликлиническая терапия». Базой для вновь создаваемой кафедры стала взрослая поликлиника МГКБ№5, которая в это время вводилась в строй. Через год, когда открылась новая поликлиника (сейчас это поликлиника №4 ГАУЗ "ГКБ им. Н.И. Пирогова" г. Оренбурга), нам представилась возможность часть учебных комнат разместить там. Таким образом, создание кафедры и ввод в строй новых крупных поликлиник практически совпали по времени.
Преподавание тогда велось только на 6 курсе лечебного факультета. В последующие годы на кафедре стали обучаться студенты 5 курса медико-профилактического факультета. С января 2000 года был создан курс постдипломной подготовки врачей по специальности «врач общей практики». В последующем изменилось название всей кафедры. Она стала называться «кафедрой общей врачебной практики». С 1 сентября 2010 года приказом ректора кафедра «общей врачебной практики» вновь переименована в кафедру «поликлинической терапии». Со дня основания кафедры по август 2019 года в должности заведующего кафедрой работала доктор медицинских наук, профессор Генриетта Георгиевна Багирова. В настоящее время заведующим кафедрой является доктор медицинских наук, профессор Василий Николаевич Аверьянов.
На кафедре поликлинической терапии ведётся преподавание на лечебном факультете студентам 5 и 6 курса. Преподавание на кафедре осуществляется 12 преподавателями, среди которых 2 доктора медицинских наук, 6 кандидатов медицинских наук.
По результатам конкурса, проведенного Российской Академией Естествознания в 2015 году, кафедра награждена дипломом «Золотая кафедра России» и нагрудным знаком «За лекторское мастерство и достижения в области развития образования в России».
